Didaktika matematiky je rozdělena na obecnou didaktiku matematiky, která není vázána konkrétním matematickým obsahem, která je obsahem vzdělávacího programu Didaktika matematiky I a na speciální didaktiku matematiky, která je vázána konkrétním matematickým obsahem, která je obsahem vzdělávacího programu Didaktika matematiky II. V rámci tohoto předmětu studenti aplikují znalosti z předmětu Didaktika matematiky I a učí se výuce odlišných témat skrze různé přístupy. Studenti se učí si vybrat vhodný učební text a samostatně tvořit úlohy různých typů. Studenti poznávají práci na malotřídních školách, ve vyrovnávacích třídách a v etnické skupině žáků. Jsou vedeni k překonávání komunikačních bariér a k řešení nezáměrně vzniklých pedagogických situací. Předmět didaktika matematiky II navazuje svým obsahem na předmět didaktika matematiky I.